הטיפול ב- hydrochlorothiazide וב- chlorthalidone מביא להשפעה קרדיווסקולארית דומה, אך האחרונה גורמת ליותר תופעות לוואי – הפרעות ברמת האלקטרוליטים ובתפקודי הכליות, אלו ממצאיו של מחקר תצפית שפורסם בכתב העת JAMA. ה- American College of Cardiology וה- American Heart Association ממליצים על chlorthalidone כתרופת הבחירה.
החוקרים השוו כ- 37,000 מטופלים שהחלו ליטול chlorthalidone עם 690,000 שהחלו ליטול hydrochlorothiazide.
השיעורים של אוטם חריף בשריר הלב, אשפוז בבית החולים עקב אי ספיקת לב ושבץ, היו דומים בקרב שתי הקבוצות, אף על פי כן, טיפול ב- chlorthalidone היה קשור עם סיכון גבוה יותר לירידה ברמות האשלגן והנתרן, אי ספיקת כליות, מחלת כליות כרונית וסוכרת סוג 2.