שיעורי החיסון השגרתיים בקרב ילדים ובני נוער פחתו בתחילת 2020 עקב ההגבלות, והם עדיין לא חזרו לשיעורם הרגיל.
חוקרי ה-CDC השוו את שיעורי החיסון בקרב ילדים ובני נוער במהלך תקופת השיא של הפנדמיה (מרץ עד ספטמבר 2020) עם השיעורים בתקופות דומות בשנים 2018 ו-2019, בעשרה אזורים בארה"ב.
ממרץ עד מאי 2020, שיעורי החיסון פחתו בכל עשרת האזורים בהשוואה לתקופות דומות בשנתיים הקודמות. למרות העליה בשיעורי החיסון לאחר ספטמבר 2020, השיעורים עדיין נמוכים מאלו הנחוצים על מנת לפצות על הירידה.
הירידה בשיעורי החיסון תואמת להגבלות ההתקהלות ולסגרים הביתיים באותן תקופות.