מחקר מקרה הביקורת העריך את ההשפעה של הגבלה דרסטית בצריכת הקלוריות על מספר, הרכב ופעילות מיקרוביום המעי. 80 נשים לאחר המנופאוזה ועם עודף משקל חולקו בצורה אקראית לדיאטה או לשמירה על משקל יציב למשך 16 שבועות. הנבדקות בקבוצת המחקר צרכו שייקים שכללו פחות מ-800 קלוריות ביום.
סך הכל, הדיאטה הפחיתה את מספר המיקרואורגניזמים במעי, את מגוון המיקרוביום ואת מספר המטאבוליטים שהופקו על ידי המיקרוביוטה.
על מנת לבדוק האם המיקרוביום במעי לבדו עשוי לתרום לירידה במשקל, נאספו דגימות צואה לפני ואחרי הדיאטה, והללו הושתלו בעכברים ללא מיקרוביום. עכברים שקיבלו צואה שנאספה לאחר הדיאטה, הדגימו ירידה במשקל והפחתה במסת השומן.