הקווים המנחים ממליצים על מתן כיסוי אמפירי נגד סופראינפקציה חיידקית לחולי קורונה המאושפזים במחלקות הטיפול הנמרץ. אנטיביוטיקה רחבת טווח ניתנת לרוב כאשר עולה החשש מפני ventilator-associated pneumonia (VAP), במרבית המקרים ללא נטילת דגימה מדרכי הנשימה התחתונות וזאת על מנת להפחית את הסיכון לצוות המטפל.
החוקרים משיקגו ערכו bronchoalveolar lavage (BAL) ל- 179 חולים שאושפזו עם כשל נשימתי הקשור לקורונה לאורך תקופה של 4 חודשים. הדגימה נשלחה לתרבית כמותית ולבדיקת multiplex polymerase chain reaction (PCR).
חיידקים אובחנו בקרב 21% מהנבדקים. רק שלושה אובחנו עם אורגניזמים עמידים (methicillin-resistant Staphylococcus aureus או Stenotrophomonas maltophilia).
שיעורי תמותה דומים נצפו בקרב חולים עם סופראינפקציה וללא סופראינפקציה.