החיידקים השוכנים במעיים מסייעים לתהליכי העיכול, תוך השפעה על חומצות המרה, המיוצרות על מנת לפרק שומנים. כעת מתברר כי ההשפעה החיידקית על חומצות המרה עשויה להשפיע גם על התפתחות סרטן המעי הגס.
הקשר בין חומצות המרה והסיכון לסרטן המעי הגס מושפע מחלבון ספציפי, המכונה FXR, המסייע לשמירה על אוכלוסיית חיידקים בריאה באמצעות יחסי הגומלין שהוא מקיים עם חומצות המרה. החלבון שולט ביצירת החומצות בכבד, אך הוא מגיב בצורה שונה לנוכחות של חומצות מרה שהושפעו מנוכחות חיידקית.
חלק מהחומצות תומכות בפעילות החלבון, בעוד שאחרות סותרות אותה, ולמעשה השפעות אלו מגינות מפני תחלואה, או לחילופין מגבירות את הסיכון לה.
