חוקרים משיקגו טוענים כי מחלת קווסאקי נגרמת על ידי נגיף נשימתי בודד, אשר עדיין לא זוהה. הממצאים נוגדים את התיאוריה כי פתוגנים רבים ושונים או רעלנים עשויים לגרום למחלה, היכולה להוביל לסיבוכים לבביים חמורים בקרב ילדים צעירים.
המחלה אינה נפוצה יחסית, ופוגעת לרוב בילדים בגילאים 6 חודשים עד 5 שנים. נכון להיום לא קיימת בדיקה אבחנתית למחלה, שסימניה הקליניים כוללים חום, פריחה, נפיחות של הגפיים, גירוי ואדמומיות של העיניים, נפיחות של קשריות הלימפה בצוואר וגירוי ודלקת של הפה, השפתיים והגרון.
לילדים החולים ישנו סיכוי של 20% לפתח מחלת לב, כאשר תינוקות מצויים בסיכון גבוה יותר לפתח סיבוכים לבביים. הטיפול הנוכחי כולל מתן אימונוגלובולינים תוך ורידיים ומשככי כאבים, על מנת להפחית את הסיכון הלבבי.