מטה-אנליזה מצאה כי Methotrexate מגבירה במעט את הסיכון לתופעות שליליות במערכת הנשימה.
תופעות במערכת הנשימה (לדוגמא: interstitial lung disease, pleural effusions, nodules) נפוצות בקרב חולי rheumatoid arthritis (RA). האבחנות המבדלות כוללות זיהומים, את המחלה עצמה, ואת תופעות הלוואי של התרופות לטיפול ב- RA. תרופות שנחשדו כגורמות לסיבוכים במערכת הנשימה כוללות תרופות לא ביולוגיות כגון sulfasalazine, methotrexate ו- leflunomide, כמו גם מספר תרופות ביולוגיות.
Methotrexate נחשדת פעמים רבות כגורם לתחלואה, אך שיעור ההיארעות של מחלות ריאות הקשורות בתרופה בקרב חולי RA אינו ידוע. על מנת להעריך את הסיכון למחלות ריאות בקרב חולי RA המטופלים ב- methotrexate, ערכו החוקרים מטה-אנליזה שכללה 22 מחקרים אקראיים מסוג מקרה-ביקורת (משך 24-104 שבועות) שהשוו methotrexate מול תרופות אחרות או פלסבו.
שיעורי התמותה ממחלות ריאות לא היו גבוהים יותר בקרב חולים שטופלו ב- methotrexate. אף על פי כן, חולים שטופלו ב- methotrexate הציגו סיכון גבוה במידה מועטה אך מובהקת סטטיסטית לסבול מתופעות לוואי במערכת הנשימה (relative risk, 1.10) ומזיהומים בדרכי הנשימה (RR, 1.11).


