החיידקים בואגינה משפיעה על הסיכון להידבק בכלמידיה, אלו ממצאיו של מחקר מקרה ביקורת שפורסם ב- Sexually Transmitted Infections.
כ- 60 נשים מאמסטרדם שנמצאו שליליות ל- Chlamydia trachomatis בתחילת המחקר אך נמצאו חיוביות שנה לאחר מכן, הושוו עם 55 נשים שהציגו בדיקה שלילית בשני המועדים. הנשים סווגו לאחת מתוך חמש קבוצות בהתבסס על הרכב המיקרוביוטה הוגינאלי שלהן.
לאחר תקנון למשתנים מרובים, נמצא כי נשים עם פלורה עשירה ב- Lactobacillus iners מציגות סיכון מוגבר להדבק ב- C. trachomatis, בהשוואה לנשים עם פלורה עשירה ב- L. crispatus (odds ratio, 2.6). הגורם היחיד הנוסף שנמצא כמגביר את הסיכון להדבקה היה קיום יחסי מין אך ללא מגורים משותפים (OR, 14.5).
