ה- Infectious Diseases Society of America עדכנה את הנחיותיה משנת 2001 בנוגע לטיפול בשלשולים מדבקים. ההנחיות שפורסמו ב- Clinical Infectious Diseases כוללות המלצות לאבחנה, טיפול ומניעה.
הקבוצה מדגישה כי בדיקות דיאגנוסטיות כגון antigen-based molecular assays רגישות יותר מהבדיקות המסורתיות ובהתאם לכך, הבדיקות החדשות עשויות לאבחן אורגניזמים רבים ושונים ולכן עולה הצורך בייעוץ עם מומחה לזיהומים שיסייע לפענח את הממצאים.
מרבית המטופלים הסובלים משלשולים אינם צריכים להיבדק להימצאותה של מחלה זיהומית, אף על פי כן, בדיקות נחוצות למטופלים מתחת לגיל 5, קשישים, וחולים עם מערכת חיסון מוחלשת, בעלי שלשול דמי, הסובלים מכאבי בטן חריפים או רגישות ביטנית או המציגים סימנים של אלח דם.
